桂林处于西江支流的桂江流域，集雨面积19288平方公里。城区有多条河流穿城而过，其中以漓江最为出名。桂林境内漓江流域面积12565平方公里，干流长295.27千米，实测多年平均径流量为128.95亿立方米，多年平均流量408.9立方米/秒。当地在漓江上游建有水库群，分别有青狮潭、斧子口、小溶江、川江水库等水库，其中最大的青狮潭水库库容约为6亿立方米。

据广西台新闻频道报道，针对此轮强降雨，为了有效应对，广西水利部门科学调度，把桂林市百年一遇洪水降到三十年一遇，极大减轻桂林洪水灾害的影响。广西水利厅组织桂林市水利局，及时对桂江上游青狮潭、斧子口、小溶江、川江4座大型水库实施科学调度，充分发挥拦洪削峰作用，共拦蓄洪水3.488亿立方米。其中，在6月15至17日第一次洪水过程中，4座水库合计拦洪2.45亿立方米，降低桂林市洪峰水位1.85米，将超百年一遇洪水下降到二到五年一遇洪水。紧接着，6月18至19日，第二次暴雨来袭，桂江上游来水再次加大，水位复涨。通过水库联合调度，拦蓄洪量1.038亿立方米，将水库工程效益发挥至极限，桂林洪峰水位降低了0.32米，将近百年一遇洪水降至超30年一遇洪水。

周运逵说，是不是与水库泄洪有关，其向水利部门了解，主要原因是由于上游的水库水位已经满了，上游来多少水只能被动地泄多少水。有部分群众认为当地当时已经不下雨了，为什么还在涨水，误认为是水库泄洪造成的。关于这方面的情况桂林市已经请专家向市民做了解释。

针对预警环节是否到位的问题，周运逵回应称，应该说这一轮强降雨在预警上，自治区和桂林市做了很多的工作，所以从政府层面来说还没有措手不及的感觉。从自治区层面来说，自治区指挥部在19日早上9点钟就召开了会商部署会，立即启动了二级应急响应。这个时候桂林漓江的水位还没有超过警戒水位，为转移群众等工作留出了宝贵时间。桂林市也发布了公告，通过媒体、短信等方式发布预警措施。市民感到有些措手不及，可能主要有几个方面的原因：1、部分群众可能不认为会有这么大的洪水。2、全网发布短信可能会有延迟，有的可能滞后才收到短信，洪水来得太快，还有群众的一些财产来不及转移，感觉到措手不及了。

对此，广西壮族自治区防汛抗旱指挥部办公室副主任、应急管理厅副厅长周运逵接受央视《新闻1+1》采访时表示，此次桂林城区出现严重内涝，主要有三个原因：1、6月16日桂林漓江刚刚发生了一次超级洪水，洪水还没有完全消退，漓江的水位还是相对比较高。2、上游多地也发生了超过250毫米的特大暴雨，形成了大量的径流。3、上游调节洪水的4座水库，在上一轮降雨过程中蓄水已经满了，发挥不了拦蓄洪水的作用。因此上游的水一来，就马上迅速倒灌进入城内，形成比较严重的洪水。

澎湃新闻6月20日走访发现，多数受访桂林市民的感受是，桂林在排水方面是挺好的，很少被淹；近期，确实出现了强降雨，但并不觉得会带来如此严重内涝；19日下午，雨已经停了，但水位突然上涨，河水倒灌致内涝。

周运逵表示，在这方面还是有一些改进的空间，特别是预警发布的时效、方式上要做进一步改进。比如说对一些老弱病残的人，怎么帮扶，怎么让他们知道，还有怎么把短信的预警更加精准，更加及时，这些也正在研究采取措施。

不少受访的当地居民认为，此次桂林城区被淹，主要是因为上游水库泄洪引起，大家措手不及。有居民对水库的调控提出了质疑，也有居民认为，水库的水满了，泄洪也是无奈之举。

奇游官网6月19日下午，由于水位上涨，河水倒灌，广西桂林城区出现严重内涝，沿江区域及市中心低洼地区被淹，水最深的地方有数米深，桂林站因进水停止运营，引起外界关注。

“如果没有上游四座水库拦洪错峰，漓江桂林站水位将由148.88米上涨至149.5米左右，桂林将（被）淹得更加严重。”报道称。但从上面报道可以看到，由于第一次洪水过程中上游水库拦洪量颇大，紧接着到6月18至19日出现更大的第二次洪水时，拦蓄洪量就打了折扣。